2× Super EvaGreen ® Master Mix for HRM

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2× Super EvaGreen ® Master Mix for HRM

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2x Super EvaGreen ® Master Mix for HRM 是一款用于实时定量 PCR 和高分辨率溶解曲线分析的专业试剂盒。

SKU: S2013 分类:
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描述

产品名称:2× Super EvaGreen ® Master Mix for HRM
产品货号:S2013
产品规格:100T,500T
产品内容

组分100T500T
A. 2 ×Master Mix1 mL5×1 mL
B. 10 × ROX reference dye0.5 mL1 mL

组分 A 包含 Super EvaGreen ® dye,dNTP,PCR buffer(含Tris 和 MgCl 2 ),热启动 Taq 聚合酶;组分 B 是 10 ×ROX 参照物。
产品参数
λabs/λem = 500/530 nm (结合 DNA)
λabs = 471 nm (未结合 DNA)
储存条件
-20℃避光保存,推荐条件下至少可以储存 6 个月以上。使用前,将产品室温下解冻,并轻轻涡旋混匀,解冻后所有实验应在冰上操作。使用后,该产品可以重新冷冻储存。

产品介绍

2x Super EvaGreen ® Master Mix for HRM 是一款用于实时定量 PCR 和高分辨率溶解曲线分析的专业试剂盒。其中 Super EvaGreen ® 是一种新型的专为 qPCR 和高分辨率溶解曲线分析设计的 DNA 结合染料,它通过一种“按需求释放”的机制,极大地降低了对 PCR 扩增的抑制性,可使双链PCR 产物的结合量达到饱和状态,所以称为“饱和染料”,不会产生 SYBR Green 的染料重排现象,能够很好的区分扩增产物之间单个碱基的差异 Super EvaGreen ® 的另一个优点是它的安全性。

本产品包含一种高保真的热启动 Taq DNA 聚合酶,该酶经过化学修饰,常温下没有活性,可避免非特异性产物的扩增。本试剂盒可用于已知 SNP 分析,未知突变基因扫描
和甲基化检测等。
Super EvaGreen ® 的突出优点是它的安全性。常规 DNA结合染料存在潜在致突变性。我们研发的 Super EvaGreen ®染料,不能透过细胞膜,因而不能与活细胞的基因组 DNA结合,确保了其安全性。然而,其他所有的商业性 PCR 荧光染料都可以在几分钟内进入细胞,如 SYBR Green I,是种众所周知的环境毒性比溴化乙锭(EB)还要大的诱变剂。
使用方法
1. 取出 2×Super EvaGreen ® Master Mix for HRM, 引物,模板,RNase-free 水,恢复至室温,轻轻涡旋,充分混匀。
2. 按照如下体系制备反应混合液:

反应组分20 μL  反应体系终浓度
2×Super EvaGreen ®10μ L
F, R 引物2 μL各 0.1-0.5 μM
模板适量见注 1
10× ROX适量见表 1
H 2 O补足至 20 μL

注意事项:
1. 模板浓度:DNA 模板的添加量通常在 100 ng 以下。因不同种类的 DNA 模板中含有的靶基因的拷贝数不同,必要时可进行梯度稀释,确定合适的 DNA 模板添加量。cDNA 作为模板时的添加量不要超过 PCR 反应液总体积的 10%。

3. 轻轻涡旋混匀反应混合液,转移固定体积至 PCR 管。
4. 运行 PCR 程序,PCR 程序设置,参考第二页。
反应程序设置
您可以根据扩增模板的性质和仪器的功能,选择以下三个程序之一进行实验。
A .两步快速扩增法
这个程序适用于大多数引物 Tm 为 60℃的扩增,溶解曲线遵循您所用仪器提供的标准流程执行。

程序温度时间循环
酶激活95 ℃2 min1
变性

退火&延伸

95 ℃

60 ℃

5 s( 见注 1)

30 s

45

注意事项
1)变性时间:如果扩增片段较短,变性时间可以低于 5 s,甚至可以低至 0 s。当变性时间设置为“0”时,它仅仅意味着温度增加到 96 ℃,然后没有停留迅速降温。设置时间 5 s可以确保 DNA 较长片段和高 GC 片段的变性。高性能的仪器会进一步增加扩增子变性的可靠性。
B . 三步扩增法
这个程序适用于扩增温度比退火温度高的实验。例如,如果扩增片段有相对较长的引物,容易产生非特异性的扩增,在更高的温度下进行延伸可以降低非特异性扩增。溶解曲线遵循您所用仪器提供的标准流程执行。

程序温度时间循环
酶激活95 ℃2 min1
变性

退火

延伸

95 ℃

50-60 ℃

72 ℃

5s45
5 s( 见注 2)
25 s( 见注3)

注意事项
2)退火温度:退火温度应根据引物 Tm 值设定,通常是 5-60 ℃为佳。不过,引物 Tm 值(和扩增温度)应该设计尽可能地接近 60 ℃(但仍在 50 – 60 ℃范围内),减少退火和变性温度之间的差距。这样温度增加所需时间更少,进而扩增效率更高。
3)扩增温度:扩增温度设定在 72 ℃对于大多数扩增子通常效率更高。然而对于富含 AT 的扩增片段(> 70%)或含有AT 富集补丁的扩增子,60 ℃延长通常可以获得更好的结果。
C .通用程序
此程序适用于几乎所有 qPCR 仪器,也适用于使用快速扩增法无法达到较好效果的扩增子。

程序温度时间循环
酶激活95 ℃5 min1
变性

退火&延伸

95 ℃

60 ℃

15 s

60 s

45

Super EvaGreen ® 染料特性
光谱特性

图 1. 在 TE 缓冲液中,结合到双链 DNA 中的 Super
EvaGreen ® 染料的激发光谱(左图)和发射光谱(右图)。
SYBR Green I 与Super EvaGreen ® 荧光染料的稳定性比较


图 2. Super EvaGreen ® 、SYBR Green I 的吸收光谱 1.2uM,
pH 9 的 Tris 缓冲液中,99℃孵育 3 h 后,两种荧光染料溶液
的相对荧光强度,ROX 作参照物。

Super EvaGreen ® 染料特性
染料的稳定性
Ames 实验显示,Super EvaGreen ® 染料没有细胞毒性和致突变性,该染料不具细胞膜渗透性(图 3),这是其低细胞毒性的一个关键因素。相反地,众所周知,SYBR Green I 荧光染料具有很强的致突变性,可能原因是其抑制了细胞内 DNA 修复机制(Ohta, etel. Mutat. Res.492, 91(2001)),而 SYBR Green I 较强的细胞毒性是由其较高的细胞膜渗透性所导致的(图 3)。
Super EvaGreen ® 、SYBR Green I 荧光染料细胞膜渗透性比较


图 3. 37℃条件下,用 SYBR Green I 或 Super EvaGreen ® (1.2uM)孵育 HeLa 细胞,分别在 5 min 或 30 min 后拍照,观察荧 光强度。SYBR Green I 迅速渗透进入细胞,然而 Super EvaGreen ® 几乎不具有细胞膜渗透性。
表 表 1 、根据 PCR 仪种类不同,推荐 ROX

PCR Instrument

推荐 ROX

使用浓度

使用量

(20uL  体系)

BioRad: iCycler, MyiQ, MiQ 2, iQ 5, CFX-96,
CFX-384, MJ Opticon, Option2, Chromo4,
MiniOpticon Qiagen: Roto-Gene Q,
Roto-Gene3000, Roto-Gene 6000
Eppendorf: Mastercycler realplex
Illumina: Eco RealTime PCR System
Cepheid: SmartCyler
Roche: LIghtCycler 480, LightCycler 2.0

No ROX

None

ABI: 7500, 7500 Fast, ViiA 7

Stratagene: MX4000P, MX3000P,

MX3005P, QuantStudio, Illumina Eco, Thmorgan

Q6,Q4

Low ROX

0.05~0.1×

(终浓度)

按 1:10 稀释 10×ROX;

添加 1~2uL 稀释后的

1×ROX 至最终反应体系

ABI: 5700, 7000, 7300, 7700, 7900, 7900HT,
7900HT Fast, StepOne, StepOne plus
High ROX
1×(终浓度)
添加 2uL 10×ROX 至最终
反应体系